“医龙”再次归来！完成了日本榜首例Batista手术收入后，由朝田龙太郎（坂口宪二 饰）带领的小队就被解散了。朝田回到了收容所，持续他的世界救援。之前任职的明真大学，格式也有所改变。前小组成员伊集院登（小池彻平 饰）、里原美纪（水川麻美 饰）等尽管还留守医院，但都因医院的状况精力欠安。
这时，一封不知来历的邮件发到了前小组成员的手上。邮件的内容是期望重组医龙小队。这个信息让小组的成员都感到既振奋又忐忑。这时一位患者被送到医院，由龙太郎当令挽救了生命。借此机会，医龙小队又再次组成，一切都朝着好的方向开展着。但朝田好像隐约感觉着背面有人在操作着这些事……。
