在一个阳光明媚的日子里，草帽海贼团的伙伴们正在某个海滩清闲休假。但是泊在岸边黄金梅利号就在他们鼻子底下被人偷走。一个礼拜后，他们依旧灰溜溜地在海上流浪。正在尴尬之时，路修等人遇见小毛贼博洛德和阿基斯。这二人正计划前往发条岛盗取贵重的钻石钟，而黄金梅利号很可能便是占据岛上的扑克牌海贼团所窃。不久他们遇见扑克牌海贼团的船队，然初次交手便告失利，娜美更被对方虏去。为了找回船和伙伴，并得到钻石钟，草帽海贼团与响马兄弟燃气斗志，向发条岛前进…… 本片依据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2001年上映的第二部动画剧场版，尾田一起担任作画监督。
