当HYDRA的隐秘不再是隐秘之后，该剧便可以全力在这方面随同剧情了。在第二季中，新任神盾局局长Coulson和他的团队成了「通缉犯」，HYDRA安排仍在追杀他们，并且可以调集的资源现已十分有限，但那不会阻挠他们持续「为国际的平和与安全而战」——究竟已知的和不知道...。
