关原之战后35年，日本在变迁的年代中逐步康复平和。但是，某天突现可怕的怪物——“群凶”，它们突击人类，以血肉为食。幕府隐秘差遣征伐队歼灭群凶，并将相关地域焚毁掩盖真相。 远离缤纷的多胡宿，曾是忍者的凛（木村文乃 饰）隐姓埋名，作为医生源三郎（高桥克实 饰）的帮手，与无血缘关系的养女时（田牧空 饰）安静日子。某日，为了获取治好时病症的药，凛远行至某村，却发现那里血迹斑斑、骸骨遍地，恐惧异形的群凶袭来。这一刻，她的沉痛往事显现脑际。为了维护如亲生女儿般宝贵的时，凛踏上了一场生死未卜的旅程。与此同时，一个仍保有人类认识，却变成“半群凶”的男人士郎（田中树 饰）被世人讨厌软禁。他苦于不知本身来历，为了解开身世之谜，踏上了寻觅或人的旅程……。
