新干线超进化研究所为了从诞生于“乌黑新干线”的巨大怪物体手中看护日本的未来， 人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。 具有与SHINKALION较高合适率的孩子们成为驾驶员， 与研究所员齐心协力，面临强壮的敌人！ 终究“乌黑新干线”的意图是……。孩子们能否看护日本的未来……。 变身！SHINKALION！
