本片是以地球人与瓦肯人的“第一类触摸”事情为布景，将重心放在《星际迷航之下一代》电视系列剧中的大敌『博格人』。 企业号正在宇宙空间做例行巡航时，舰长皮卡特接到密电，称博格人已联合其他星系的力气，预备向地球建议进犯。因为舰长皮卡特曾受敌方俘虏并同化，星际舰队对其不很信赖，故没有派其出战。皮卡特不管指令，依然参加战役，之后企业号跟从博格人的时刻漩涡回到21世纪，以阻挠博格人妄图改动人类的外星发展史到达降服地球的妄图。
