连续前一集的剧情，狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 David Schwimmer 配音）、河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 Jada Pinkett Smith 配音）以及企鹅们，为了能脱离马达加斯加岛回到五颜六色的纽约，对一架寒酸的失事飞机进行修理改造，并成功起飞。当我们现已开端庆祝总算能够回到纽约时，飞机却意外下降，迫降到了非洲大草原上。在这儿，狮子亚历克斯总算见到了它的爸爸妈妈。可是由于日子习性上太多不一样，并且言行举止各异，使得这群纽约来的动物们显得方枘圆凿。这群志同道合纽约中央公园的动物明星们，在这户外困难的环境中应该怎么办？虽然在这儿遇见了自己的同类，但由于习性不同，使得自己无法彻底融入他们的集体。为了能融入环境，与同类们树立杰出的联系，我们都是发挥各种招式，笑料百出。
