明朝崇祯15年，全国内忧外患，大将孙传庭临危受命带着妻子冯氏来到潼关反抗李自成的戎行。与此一起游医吴又可怀着济世救人之心来到潼关访问师傅——药局提领赵川。大敌当前，孙传庭军中战士染上怪病，一起还要面临崇祯皇帝的敦促出动军队和潼关豪绅顾清远等人的自私敛财。赵川因施救不力以身许国，吴又可在危险之时挺身而出，靠着不同寻常的医治办法与孙传庭志同道合。最终瘟疫总算被控制住，可是国家的病症能否被战役治好吴又可和孙传庭都无法意料。
